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GeuvadisTranscriptExpr
DOI:10.18129 / B9.bioc.GeuvadisTranscriptExpr
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeuvadisTranscriptExpr。
数据包的转录表达和bi-allelic基因型GEUVADIS项目
Bioconductor版本:3.11
提供成绩单表达式和bi-allelic基因型对应的染色体19 CEU个人GEUVADIS项目Lappalainen et al。
作者:马格达雷娜Nowicka (aut (cre)
维护人员:马格达雷娜Nowicka < gosia。在uzh.ch nowicka >
从内部引用(R,回车引用(“GeuvadisTranscriptExpr”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GeuvadisTranscriptExpr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GeuvadisTranscriptExpr”)
| R脚本 | 转录表达和基因型的预处理和制备sQTL GEUVADIS项目的分析 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ExperimentData,ExpressionData,基因组,Homo_sapiens_Data,RNASeqData,SNPData,SequencingData |
| 版本 | 1.16.0 |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | R (> = 3.3.0) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | limma,rtracklayer,GenomicRanges,Rsamtools,VariantAnnotation、工具、BiocStyle,knitr,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | DRIMSeq |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GeuvadisTranscriptExpr_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeuvadisTranscriptExpr |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeuvadisTranscriptExpr |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GeuvadisTranscriptExpr/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
