flowsorted.blood.epic

doi:10.18129/b9.bioc.flowsorted.blood.epic

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅flowsorted.blood.epic

Illumina Epic数据有关免疫磁分选的外周成年血细胞

生物导体版本:3.11

原始数据对象用于MinFI和类似包装中的血细胞比例估计。flowsorted.blood.pepic对象基于布罗克·克里斯滕森(Brock Christensen)和同事分析的样品;有关详细信息,请参见Salas等。2018. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/query/acc.cgi?acc=gse110554。

作者:Lucas A. Salas [Cre,Aut],Devin C. Koestler [AUT],Rondi A. Butler [CTB],Helen M. Hansen [CTB],John K. Wiencke [CTB],Karl T. Kelsey [CTB [CTB],布罗克·克里斯滕森[CTB],卡斯珀·丹尼尔·汉森[CTB](最初的Minfi Estrecellcounts和Internaltions的作者和维护者),Jean-Philippe Fortin [CTB]V. Andrews [CTB](原始Minfi EstapeCellCounts和Internalltions的贡献者),E。AndresHouseman [CTB](用于细胞投影的原始二次编程功能的作者),Andrew E Jaffe [CTB](原始的作者Minfi中的估计元素和内部功能)

维护者:卢卡斯·萨拉斯(Lucas A. Salas)

引用(从r内,输入引用(“ flowsorted.blood.epic”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ flowsorted.blood.epic”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ flowsorted.blood.epic”)

html R脚本 flowsorted.blood.epic
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,基因组,,,,homo_sapiens_data,,,,甲基化arraydata,,,,微阵列,,,,组织,,,,组织血性arraydata
版本 1.6.1
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5),Minfi(> = 1.21.2),总结性特征,,,,GeneFilter,,,,Quadprog,,,,nlme,,,,S4VECTORS,图形,统计,utils,Illuminahumanmethylationepicanno.ILM10B4.HG19,,,,实验室
进口
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,繁殖,,,,Flowsorted.cordbloodcombined.450k,,,,Flowsorted.blood.450k(> = 1.0.1),Flowsorted.cordblood.450k,,,,Flowsorted.cordbloodnorway.450k,,,,测试,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest(> = 0.2.0),Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19(> = 0.2.1),Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19
系统要求
增强
URL https://github.com/immunometholomics/flowsorted.blood.epic
BugReports https://github.com/immunometholomics/flowsorted.blood.epic/issues。
取决于我 Flowsorted.cordbloodcombined.450k
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 flowsorted.blood.epic_1.6.1.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowsorted.blood.epic
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/flowsorted.blood.epic
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/flowsorted.blood.epic/
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