此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅flowsorted.blood.epic。
生物导体版本:3.11
原始数据对象用于MinFI和类似包装中的血细胞比例估计。flowsorted.blood.pepic对象基于布罗克·克里斯滕森(Brock Christensen)和同事分析的样品;有关详细信息,请参见Salas等。2018. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/query/acc.cgi?acc=gse110554。
作者:Lucas A. Salas [Cre,Aut],Devin C. Koestler [AUT],Rondi A. Butler [CTB],Helen M. Hansen [CTB],John K. Wiencke [CTB],Karl T. Kelsey [CTB [CTB],布罗克·克里斯滕森[CTB],卡斯珀·丹尼尔·汉森[CTB](最初的Minfi Estrecellcounts和Internaltions的作者和维护者),Jean-Philippe Fortin [CTB]V. Andrews [CTB](原始Minfi EstapeCellCounts和Internalltions的贡献者),E。AndresHouseman [CTB](用于细胞投影的原始二次编程功能的作者),Andrew E Jaffe [CTB](原始的作者Minfi中的估计元素和内部功能)
维护者:卢卡斯·萨拉斯(Lucas A. Salas)
引用(从r内,输入引用(“ flowsorted.blood.epic”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ flowsorted.blood.epic”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ flowsorted.blood.epic”)
html | R脚本 | flowsorted.blood.epic |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 实验数据,,,,基因组,,,,homo_sapiens_data,,,,甲基化arraydata,,,,微阵列,,,,组织,,,,组织血性arraydata |
版本 | 1.6.1 |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.5),Minfi(> = 1.21.2),总结性特征,,,,GeneFilter,,,,Quadprog,,,,nlme,,,,S4VECTORS,图形,统计,utils,Illuminahumanmethylationepicanno.ILM10B4.HG19,,,,实验室 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,繁殖,,,,Flowsorted.cordbloodcombined.450k,,,,Flowsorted.blood.450k(> = 1.0.1),Flowsorted.cordblood.450k,,,,Flowsorted.cordbloodnorway.450k,,,,测试,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest(> = 0.2.0),Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19(> = 0.2.1),Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/immunometholomics/flowsorted.blood.epic |
BugReports | https://github.com/immunometholomics/flowsorted.blood.epic/issues。 |
取决于我 | Flowsorted.cordbloodcombined.450k |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | flowsorted.blood.epic_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowsorted.blood.epic |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/flowsorted.blood.epic |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/flowsorted.blood.epic/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |