org.Mm.eg.db
DOI:
10.18129 / B9.bioc.org.Mm.eg.db
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅org.Mm.eg.db。
对小鼠全基因组注释
Bioconductor版本:3.11
小鼠全基因组注释,主要基于映射使用Entrez基因标识符。
作者:马克·卡尔森
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“org.Mm.eg.db”)
):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“org.Mm.eg.db”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
细节
biocViews |
AnnotationData,Mus_musculus,OrgDb,mouseLLMappings |
版本 |
3.11.4 |
许可证 |
艺术- 2.0 |
取决于 |
R(> = 2.7.0)、方法AnnotationDbi(> = 1.49.2) |
进口 |
方法,AnnotationDbi |
链接 |
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建议 |
DBI,注释,RUnit |
SystemRequirements |
|
增强了 |
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URL |
|
取决于我 |
注释,clariomsmousehttranscriptcluster.db,clariomsmousetranscriptcluster.db,illuminaMousev1.db,illuminaMousev1p1.db,illuminaMousev2.db,lumiMouseAll.db,m10kcod.db,m20kcod.db,mgu74a.db,mgu74av2.db,mgu74b.db,mgu74bv2.db,mgu74c.db,mgu74cv2.db,mguatlas5k.db,mgug4104a.db,mgug4120a.db,mgug4121a.db,mgug4122a.db,mi16cod.db,mm24kresogen.db,MmAgilentDesign026655.db,moe430a.db,moe430b.db,moex10stprobeset.db,moex10sttranscriptcluster.db,mogene10stprobeset.db,mogene10sttranscriptcluster.db,mogene11stprobeset.db,mogene11sttranscriptcluster.db,mogene20stprobeset.db,mogene20sttranscriptcluster.db,mogene21stprobeset.db,mogene21sttranscriptcluster.db,mouse4302.db,mouse430a2.db,mpedbarray.db,mta10probeset.db,mta10transcriptcluster.db,mu11ksuba.db,mu11ksubb.db,Mu15v1.db,mu19ksuba.db,mu19ksubb.db,mu19ksubc.db,Mu22v3.db,Mus.musculus,mwgcod.db,nugomm1a520177.db,RnaSeqGeneEdgeRQL |
进口我 |
artMS,cellity,chimeraviz,chipenrich,debrowser,eegc,EGSEA,GAPGOM,GmicR,PathwaySplice,profileplyr,Rmmquant,rTRMui,scPipe,tenXplore |
建议我 |
注释,annotatr,APAlyzer,CAGEfightR,CAGEWorkflow,CellTrails,chipenrich.data,chipseqDB,compEpiTools,csaw,csawUsersGuide,小伙子,fgsea,gCMAPWeb,gCrisprTools,GeneAnswers,geneXtendeR,GenomicFeatures,girafe,InPAS,isomiRs,karyoploteR,中长期规划,MmPalateMiRNA,NoRCE,ontoProc,Organism.dplyr,pathview,Pigengene,ReportingTools,restfulSE,RnBeads,RpsiXML,rrvgo,rTRM,simpleSingleCell,singleCellTK,TimeSeriesExperiment,ViSEAGO |
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