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XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
DOI:10.18129 / B9.bioc.XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37。
额外的SNP地点智人(dbSNP构建144)
Bioconductor版本:3.11
额外的SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP构建144。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月29 - 30日,2015年,包含snp GRCh37映射到参考基因组。p13 (GRCh37的补丁版本,并不改变染色体22页,X, Y, MT)。而SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144。GRCh37包只包含分子变化类“国民党”,这个包包含其他类的分子变化(named-locus (del、杂合的微卫星,缺乏变化,混合,和multinucleotide-polymorphism)。
作者:Herve页面
维修工:h .页< hpages fhcrc.org >
从内部引用(R,回车引用(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,XtraSNPlocs |
| 版本 | 0.99.12 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.10),BSgenome |
| 进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
| 链接 | |
| 建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | appreci8R |
| 建议我 | |
| 我的链接 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37_0.99.12.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
