TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene．

TxDb对象的注释包

Bioconductor版本:3.11

通过将UCSC生成的注释数据库公开为TxDb对象来公开

作者:Marc Carlson, Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor .org> [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，TxDb
版本	3.2.2
许可证	艺术- 2.0
取决于	GenomicFeatures(> = 1.21.30)
进口	AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	注释，嵌合体，FDb.InfiniumMethylation.hg19，FunciSNP，Homo.sapiens，变体，火神
进口我	阿尔卑斯山脉，appreci8R，ChIPQC，ChIPseeker，decompTumor2Sig，希尔达，profileplyr，RareVariantVis，rCGH
建议我	AllelicImbalance，AnnotationDbi，annotatr，ATACseqQC，beadarray，BiocOncoTK，BiocParallel，biomvRCNS，biovizBase，bumphunter，cgdv17，chipenrich.data，ChIPpeakAnno，chromPlot，cpvSNP，CRISPRseek，derfinder，derfinderPlot，esATAC，弗雷泽，GA4GHclient，GA4GHshiny，计，geneAttribution，《创世纪》，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，GenomicScores，GenVisR，ggbio，gmapR，gQTLstats，groHMM，GUIDEseq，gwascat，HTSeqGenie，InPAS，karyoploteR，桅杆，methyAnalysis，MutationalPatterns，NoRCE，先驱者，PureCN，R3CPET，regionReport，RiboProfiling，rtracklayer，SGSeq，SigFuge，SplicingGraphs，SummarizedExperiment，TCGAutils，TFEA。芯片，trackViewer，transcriptR，tximport，VariantAnnotation，VariantFiltering
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene_3.2.2.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene/
软件包下载报告	下载数据