bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked

Mus Musculus的完整掩盖基因组序列(UCSC版本MM10)

生物导体版本:3.11

UCSC(MM10,2011年12月)提供的Mus Musculus(小鼠)的完整基因组序列,并存储在生物弦物体中。这些序列与BSGENOME.MMUSCULUS.UCSC.MM10中的序列相同,除了每个序列都在顶部具有2个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(AGAPS掩码)和(2)(2)内部的掩码。contig歧义(amb掩膜)。

作者:生物导体开发团队

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked”)):

安装

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if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.mmusculus.ucc.mmsc.mm10.masked”)

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文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,mus_musculus
版本 1.3.99
执照 艺术2.0
要看 BSGENOME(> = 1.31.8),bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10
进口 BSGENOME,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10
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源包 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked_1.3.99.tar.gz
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