此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked。
生物导体版本:3.11
UCSC(MM10,2011年12月)提供的Mus Musculus(小鼠)的完整基因组序列,并存储在生物弦物体中。这些序列与BSGENOME.MMUSCULUS.UCSC.MM10中的序列相同,除了每个序列都在顶部具有2个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(AGAPS掩码)和(2)(2)内部的掩码。contig歧义(amb掩膜)。
作者:生物导体开发团队
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.mmusculus.ucc.mmsc.mm10.masked”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,mus_musculus |
版本 | 1.3.99 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | BSGENOME(> = 1.31.8),bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10 |
进口 | BSGENOME,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10 |
链接 | |
建议 | |
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建议我 | podkat,,,,R3CSEQ |
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源包 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked_1.3.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked/ |
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