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BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked
DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked。
完整的蒙面基因组序列背带吊裤带(galGal3 UCSC的版本)
Bioconductor版本:3.11
完整的基因组序列背带吊裤带(鸡)提供的UCSC (galGal3, 2006年5月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Ggallus.UCSC序列是一样的。galGal3,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。
作者:Bioconductor Dev团队
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | AnnotationData,BSgenome,Gallus_gallus,遗传学 |
| 版本 | 1.3.99 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3 |
| 进口 | BSgenome,BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3 |
| 链接 | |
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| 我的链接 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked_1.3.99.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
