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在微阵列的经验贝叶斯分析中，为一组模糊因子的值生成(logit转换)后验概率图。
plot(x, y, logit = TRUE, pos.legend = NULL, legend。cex = 0.8, col = NULL, main = NULL, xlab = NULL, ylab = NULL，只有。a0 = FALSE, lty = 1, lwd = 1, y.s intersp = 1.1，…)
x |
FindA0类的对象 |
y |
delta值，即一个基因被称为差异表达的最小概率 |
分对数 |
后验概率在绘制之前应该进行对数变换吗? |
pos.legend |
0 ~ 4之间的整数。如果pos.stats = 1，一般信息为显著基因的数量和估计的FDR为指定值y将被绘制在地块的上方中心。如果pos.stats = 2，这些信息将被绘制在右下角，如果pos.stats = 3在左下角，如果pos.stats = 4在左上角。如果pos.stats = 0，不绘制任何信息。默认情况下,pos.stats = 1如果表达式得分可以是正的，也可以是负的，和pos.stats = 4如果它们只能取正值 |
legend.cex |
图例中文本相对于默认大小的大小 |
上校 |
为不同的模糊因子值指定线条颜色的向量a0．有关如何指定颜色的说明，请参阅的帮助票面价值 |
主要 |
命名情节主标题的字符串 |
xlab |
命名x轴标签的字符串 |
ylab |
命名y轴标签的字符串 |
only.a0 |
如果真正的，只有价值观a0如图例所示。如果假的值a0并显示了相应数量的差异表达基因 |
lty |
指定曲线的直线类型的值或向量。具体操作请参见票面价值 |
lwd |
指定绘制线宽度的数值。具体操作请参见票面价值 |
y.intersp |
一个数值，指定图例中行与行之间的间距 |
.．. |
后验概率图的进一步图形参数。的帮助页plot.default而且票面价值 |
一组蒙混因子值的基因后验概率(logit转换)图
Holger Schwender,holger.schw@gmx.de
Efron, B.， Tibshirani, R.， Storey, J.D.和Tusher, V.(2001)。微阵列实验的经验贝叶斯分析，JASA， 96, 1151-1160。
施文德，H.，克劳斯，A.和伊克施塔特，K.(2003)。经验贝叶斯与微阵列显著性分析的比较。技术报告， SFB 475，多特蒙德大学，德国。