1.21.1 o mlpBarplot:添加ylab cex,使用标题,而不是多行文字设置标题o plotGOgraph:添加nCutDescPath,替换的\ \ \ n \ n”,添加错误当图没有边缘1.5.2 o删除要求(mouse4302mmentrezg.db)调用控制R CMD从1.5.0 o更新exampleGeneSet给予不适当的警告。rda使用。BioC 2.11 db 1.4.2 o getGeneSets进一步改进和addGeneSetDescription 1.4.1 o o 1.3.0更好的检查geneSetSource getGeneSets版本更新使用新的注释包搬到阿roxygen2 1.2.1 o也出口addGeneSetDescription 1.2.0 o BioC release 2.9 1.1.1 o更新使用新的注释包o应用更改列排列(由希瑟·特纳)0.99.5 o reactome进一步适应使用。db包0.99.4 o适应MLP reactome使用。db包(威廉Ligtenberg) 0.99.3 o修复mlpBarplot (p值= 0)报告和修补威廉Ligtenberg 0.99.2 o修复bug在plotGeneSetSignificance 0.99.1 o修复mouse4302 (barColors论点)。db依赖的小插图0.99.0 o不再出口效用函数0.0 -14 o添加示例来帮助页0.0 -13 2.12 o符合R。x 0.0 -12 o修复主要标题处理plotGOgraph o修复主要标题处理mlpBarplot以防geneSetSource外部数据(数据帧)0.0 -11 o修复在plotGeneSetSignificance (psid) o错误消息文件0.0 -10 o更新装饰图案o改变延时函数的参数criticalValues probabilityVector o微不足道的示例数据集变化0.0 9 o更新默认的情节(灰色鳞片。类型=“barplot”) o默认灰色plotGeneSetSignificance设置为“grey50”o实质性改进装饰图案(一)o统一使用“主要”的理由主要标题情节功能0.0 8点添加狗物种funcionality getGeneSets(公共和KEGG注释只)o getGeneSets:取代eset论点通过entrezIdentifiers论点o用geneSetSource代替pathwaySource均匀性在所有功能(尤其是getGeneSets) o情节(。类型=“barplot”)现在允许指定颜色的酒吧(barColors论点),包括修复o修复颜色和传奇故事情节(。类型=“GOgraph”)添加plotGeneSetSignificance o字符类型强加于geneSetDescription延时输出(而非因素)0.0 7 o添加类型=“GOgraph”情节MLP方法对象o简陋的小插图包括0.0草案6 o pathwaySource信息存储在延时输出对象o addGeneSetDescription融入延时函数,并相应地调整mlpBarplot o除去quantileCurves情节参数(参数没有使用)o介绍情节方法支持类型=“barplot”和类型=“quantileCurves”0.0 - 5 o goAnnotation换成了更一般的getGeneSets(用于其他途径来源比数据库)o添加mlpBarplot 0.0 - 4 o的加速goAnnotation和addGeneSetDescription o更名为总结。延时addGeneSetDescription o添加支持文档修复o阿狗删除(弃用)goInputMLP o去除goAnnotation o的死代码删除pperm, tStatistic及其效用函数(limma优先)0.0 - 3 o修复probeset名称(排除非数字的)0.0 - 2 o修复在总结。延时0.0 - 1 o第一个包版本