DOI:10.18129 / B9.bioc.yarn

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见

YARN:鲁棒多条件RNA-Seq预处理和归一化

Bioconductor版本:3.11

使用先前开发的工具组合加速大型RNA-Seq分析。YARN的目的是让用户更容易执行基本的错误注释质量控制、过滤和感知条件的规范化。YARN利用许多Bioconductor工具和统计技术来解释在非常大的RNA-seq实验中发现的巨大异质性和稀疏性。

作者:Joseph N Paulson [aut, cre], Cho-Yi Chen [aut], Camila lope - ramos [aut], Marieke Kuijjer [aut], John Platig [aut], Abhijeet Sonawane [aut], Maud Fagny [aut], Kimberly Glass [aut], John Quackenbush [aut]

维护者:Joseph N Paulson < Paulson。约瑟夫在gene.com>上报道

引文(从R内,输入引用(“纱线”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("yarn")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“纱线”)

PDF R脚本 YARN:鲁棒多组织rna序列预处理和归一化
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释聚类GeneExpression归一化预处理质量控制测序软件可视化
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase
进口 biomaRt下载器刨边机gplots、图形、limmamatrixStatspreprocessCorereadrRColorBrewer统计数据,quantro
链接
建议 knitrrmarkdowntestthat(> = 0.8)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 yarn_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 yarn_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) yarn_1.14.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yarn
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/yarn
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/yarn/
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