Yaqcaffy

doi:10.18129/b9.bioc.yaqcaffy

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Yaqcaffy

Affymetrix表达数据质量控制和可重复性分析

生物导体版本:3.11

使用MAQC参考数据集对人类全基因组芯片的Affymetrix Genechip表达数据和可重复性分析的质量控制。

作者:Laurent Gatto

维护者:laurent Gatto

引用(从r内,输入引用(“ Yaqcaffy”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ yaqcaffy”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Yaqcaffy”)

PDF R脚本 Yaqcaffy:Affymetrix质量控制和MAQC可重复性
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件
版本 1.48.0
在生物导体中 Bioc 2.2(R-2.7)(12。5年)
执照 艺术2.0
要看 简单(> = 2.19.3),方法
进口 Stats4
链接
建议 maqcsubsetafx,,,,Affydata,,,,Xtable,,,,TCLTK2,tcltk
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 QCMetrics
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 yaqcaffy_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 yaqcaffy_1.48.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) yaqcaffy_1.48.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yaqcaffy
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/yaqcaffy
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/yaqcaffy/
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