Weitrix

doi:10.18129/b9.bioc.weitrix

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Weitrix

加权矩阵操纵,查找加权或稀疏数据变化的组成部分

生物导体版本:3.11

数据类型和工具,用于使用具有精确权重和缺少数据的矩阵。该软件包提供了一种常见的表示和工具,可以与许多类型的高通量数据一起使用。权重的含义与基本r函数“ LM”和软件包“ Limma”中的使用兼容。通过缩放权重来校准权重,以说明已知的精度预测指标。即使有许多缺失的值,也可以找到类似PCA的变化组件,即旋转,以便可以有意义地解释单个组件。支持延迟的矩阵和生物比较。

作者:保罗·哈里森[AUT,CRE]

维护者:Paul Harrison

引用(从r内,输入引用(“ Weitrix”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ weitrix”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Weitrix”)

html 1.概念和实用细节
html R脚本 2. poly(a)尾巴长度示例
html R脚本 3.替代聚腺苷酸化
html R脚本 4. RNA-seq表达示例
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,维度,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,回归,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(0.5岁)
执照 LGPL-2.1 |文件执照
要看 r(> = 4.0),总结性特征
进口 方法,utils,stats,断言,,,,S4VECTORS,,,,延迟,,,,延迟的matrixstats,,,,生物比较,,,,生物基因,,,,林玛,,,,dplyr,,,,purrr,,,,GGPLOT2,,,,,,,,RESHAPE2,,,,Rhpcblasctl
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,平淡无奇,,,,呼吸道,,,,EDGER,,,,TopConfects,,,,ensdb.hsapiens.v86,,,,org.sc.sgd.db,,,,AnnotationDbi,,,,测试(> = 2.1.0)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 weitrix_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 weitrix_1.0.0.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) weitrix_1.0.0.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/weitrix
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/weitrix
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/weitrix/
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