此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Weitrix。
生物导体版本:3.11
数据类型和工具,用于使用具有精确权重和缺少数据的矩阵。该软件包提供了一种常见的表示和工具,可以与许多类型的高通量数据一起使用。权重的含义与基本r函数“ LM”和软件包“ Limma”中的使用兼容。通过缩放权重来校准权重,以说明已知的精度预测指标。即使有许多缺失的值,也可以找到类似PCA的变化组件,即旋转,以便可以有意义地解释单个组件。支持延迟的矩阵和生物比较。
维护者:Paul Harrison
引用(从r内,输入引用(“ Weitrix”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ weitrix”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Weitrix”)
html | 1.概念和实用细节 | |
html | R脚本 | 2. poly(a)尾巴长度示例 |
html | R脚本 | 3.替代聚腺苷酸化 |
html | R脚本 | 4. RNA-seq表达示例 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,维度,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,回归,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(0.5岁) |
执照 | LGPL-2.1 |文件执照 |
要看 | r(> = 4.0),总结性特征 |
进口 | 方法,utils,stats,断言,,,,S4VECTORS,,,,延迟,,,,延迟的matrixstats,,,,生物比较,,,,生物基因,,,,林玛,,,,dplyr,,,,purrr,,,,GGPLOT2,,,,秤,,,,RESHAPE2,,,,Rhpcblasctl |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,平淡无奇,,,,呼吸道,,,,EDGER,,,,TopConfects,,,,ensdb.hsapiens.v86,,,,org.sc.sgd.db,,,,AnnotationDbi,,,,测试(> = 2.1.0) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | weitrix_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | weitrix_1.0.0.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | weitrix_1.0.0.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/weitrix |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/weitrix |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/weitrix/ |
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