vidger

doi:10.18129/b9.bioc.vidger

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅vidger

在R中创建RNASEQ数据的快速可视化

生物导体版本:3.11

Vidger的目的是快速生成信息丰富的可视化,以解释三种广泛使用的工具:Cuffdiff,Deseq2和Edger。

作者:Brandon Monier [AUT,CRE],Adam McDermaid [aut],Jing Zhao [aut],Qin MA [AUT,FND]

维护者:brandon monier

引用(从r内,输入引用(“ vidger”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ vidger”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Vidger”)

html R脚本 用Vidger可视化RNA-seq数据
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,可视化
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(2。5年)
执照 GPL-3 |文件执照
要看 R(> = 3.5)
进口 生物酶,,,,deseq2,,,,EDGER,,,,ggally,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,尼特,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown,,,,,统计总结性特征,,,,花花公子,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/btmonier/vidger//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/vidger.html
BugReports https://github.com/btmonier/vidger/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 vidger_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 vidger_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) vidger_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vidger
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/vidger
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/vidger/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网