此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅vidger。
生物导体版本:3.11
Vidger的目的是快速生成信息丰富的可视化,以解释三种广泛使用的工具:Cuffdiff,Deseq2和Edger。
作者:Brandon Monier [AUT,CRE],Adam McDermaid [aut],Jing Zhao [aut],Qin MA [AUT,FND]
维护者:brandon monier
引用(从r内,输入引用(“ vidger”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ vidger”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Vidger”)
html | R脚本 | 用Vidger可视化RNA-seq数据 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |文件执照 |
要看 | R(> = 3.5) |
进口 | 生物酶,,,,deseq2,,,,EDGER,,,,ggally,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,尼特,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown,,,,秤,统计总结性特征,,,,花花公子,UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/btmonier/vidger//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/vidger.html |
BugReports | https://github.com/btmonier/vidger/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | vidger_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | vidger_1.8.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | vidger_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vidger |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/vidger |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/vidger/ |
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