tspair

DOI:10.18129 / B9.bioc.tspair

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见tspair．

微阵列分类的最高评分对

Bioconductor版本:3.11

这些函数计算出在两个用户指定的组之间显示出排名最大差异的一对基因。使用数据集中的一对基因，这个“最高得分对”最大化了所有基于等级的分类器的敏感性和特异性的平均值。仅根据一对基因的相对级别对样本进行分类的优点是(a)分类器比更复杂的分类方案简单得多，而且往往更易于解释;(b)如果阵列可以仅使用一对基因进行分类，基于PCR的测试可以用于样本分类。有关TSP分类器的引用，请参阅tspcalc()函数的引用。

作者:Jeffrey T. Leek

维护者:Jeffrey T. Leek

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("tspair")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tspair”)

PDF	R脚本	tspTutorial
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，软件
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(11.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.10)，Biobase(> =测试盒框)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tspair_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	tspair_1.46.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	tspair_1.46.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tspair
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tspair
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tspair/
软件包下载报告	下载数据