三人组

DOI:10.18129 / B9.bioc.trio

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅三人组。

检测单核苷酸多态性和SNP交互Case-Parent三人研究

Bioconductor版本:3.11

检测单核苷酸多态性和SNP基因型的交互的TDT。这个包此外包含函数计算成对值LD措施和确定LD街区,以及功能设置匹配情况下pseudo-control基因型数据case-parent三人小组为了运行三个逻辑回归,在三人小组将缺失的基因型,为模拟case-parent三人小组与疾病风险依赖SNP交互,对权力和样本量计算三个数据。

作者:Holger Schwender清丽,菲利普·伯杰,玛格丽特•陶布Christoph Neumann Ingo Ruczinski

维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“三”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(“三”)

PDF	R脚本	三个逻辑回归和基因型的TDT
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本	3.26.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(7年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 3.0.1)
进口	grDevices、图形方法、统计数据生存跑龙套,siggenes,LogicReg(> = 1.6.1)
链接
建议	haplo.stats,mcbiopi样条函数,logicFS(> = 1.28.1),KernSmooth,VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	trio_3.26.0.tar.gz
Windows二进制	trio_3.26.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	trio_3.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trio
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/三人
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/trio/
包下载报告	下载数据