triform

DOI:10.18129 / B9.bioc.triform

这个包是Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅triform。

Triform发现丰富地区(山峰)转录因子ChIP-sequencing数据

Bioconductor版本:3.11

Triform算法使用模范自由统计识别峰样分布的TF芯片测序读,利用一种改进的峰值定义结合已知剖面特征。

作者:卡尔Kornacker开发者(aut),托尼Handstad开发者(aut (cre)

维护人员:托马斯·卡罗尔< tc.infomatics gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“triform”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“triform”)

PDF	R脚本	Triform用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,测序,软件
版本	1.29.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(8年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.11.0),IRanges,yaml
进口	BiocGenerics,IRanges(> = 2.5.27),yaml
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	triform_1.29.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/triform
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ triform
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/triform/
包下载报告	下载数据