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tracktables
DOI:10.18129 / B9.bioc.tracktables
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tracktables。
构建IGV追踪和HTML报告
Bioconductor版本:3.11
方法来创建复杂的IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的HTML页面。
作者:汤姆·卡罗尔Sanjay Khadayate安妮Pajon,紫薇梁
维护人员:汤姆卡罗尔< tc.infomatics gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“tracktables”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tracktables”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“tracktables”)
| R脚本 | 创建与tracktables IGV HTML报告 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ReportWriting,测序,软件 |
| 版本 | 1.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(6年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | R (> = 3.0.0) |
| 进口 | IRanges,GenomicRanges,XVector,Rsamtools,XML,tractor.base,stringr,RColorBrewer、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | tracktables_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tracktables_1.22.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | tracktables_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tracktables |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
