这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅trackViewer。
Bioconductor版本:3.11
可视化映射读取连同注释作为门店的数据集,如ChIP-seq追踪层,RNA-seq, miRNA-seq DNA-seq、单核苷酸多态性和甲基化数据。
作者:Jianhong Ou (aut (cre)朱,朱莉利华国际(aut)
维护人员:Jianhong Ou <,或者在duke.edu >
从内部引用(R,回车引用(“trackViewer”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“trackViewer”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“trackViewer”)
HTML | R脚本 | trackViewer装饰图案 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,可视化 |
版本 | 1.24.2 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(6.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.5.0), grDevices,方法,GenomicRanges、网格 |
进口 | GenomeInfoDb,GenomicAlignments,GenomicFeatures,Gviz,Rsamtools,S4Vectors,rtracklayer,BiocGenerics,尺度、工具、IRanges,AnnotationDbi,grImport,htmlwidgets,plotrix,Rgraphviz,InteractionSet,图,跑龙套 |
链接 | |
建议 | biomaRt,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,RUnit,org.Hs.eg.db,BiocStyle,knitr,VariantAnnotation,httr,htmltools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | NADfinder |
建议我 | ATACseqQC,ChIPpeakAnno |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | trackViewer_1.24.2.tar.gz |
Windows二进制 | trackViewer_1.24.2.zip |
macOS 10.13(高山脉) | trackViewer_1.24.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackViewer |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ trackViewer |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/trackViewer/ |
包下载报告 | 下载数据 |