subSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.subSeq

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见subSeq．

高通量测序计数数据的子采样

Bioconductor版本:3.11

用于实验设计和分析的高通量测序计数数据的子采样。

作者:David Robinson, John D. Storey, Andrew J. Bass撰稿

维护者:Andrew J. Bass ， John D. Storey

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“subSeq”)

PDF	R脚本	subSeq例子
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，转录
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.2)
进口	data.table，dplyr，tidyr，ggplot2，magrittr，qvalue(> = 1.99),消化，Biobase
链接
建议	limma，刨边机，DESeq2，DEXSeq(> = 1.9.7),testthat，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/StoreyLab/subSeq
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	subSeq_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	subSeq_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	subSeq_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/subSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/subSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/subSeq/
软件包下载报告	下载数据