寄居
DOI:10.18129 / B9.bioc.sojourner
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅寄居。
统计分析的单分子轨迹
Bioconductor版本:3.11
单分子跟踪已经演变为一部小说新方法补充基因组测序,它报告活生物物理属性的分子被调查除了属性相关的编码序列;这里我们提供“寄居”方案,解决相关统计和生物需求的分析和理解高通量单分子跟踪数据。
作者:刘盛(aut),太阳Jay Yoo (aut),小唐Na (aut),年轻的秀唱(aut),卡尔·吴(aut), Anand Ranjan[所有],Vu阮[所有],寄居的开发者(cre)
维护人员:寄居开发者< sojourner.developer outlook.com >
从内部引用(R,回车引用(“寄居”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“寄居”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“寄居”)
| HTML | R脚本 | 旅居者:R包单分子轨迹的统计分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 软件,技术,WorkflowStep |
| 版本 | 1.2.1 " |
| Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | |
| 进口 | ggplot2,dplyr,reshape2,gridExtra,EBImage,质量,R.matlab,Rcpp,fitdistrplus,mclust,minpack.lm,mixtools,mltools,nls2,plyr,rtiff,sampSurf,尺度,闪亮的,shinyjs,sp,truncnorm,跑龙套,统计数据,象图,rlang、图形、grDevices网格,编译器,晶格 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/sheng-liu/sojourner |
| BugReports | https://github.com/sheng-liu/sojourner/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | sojourner_1.2.1.tar.gz |
| Windows二进制 | sojourner_1.1.1.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | sojourner_1.2.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sojourner |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/寄居 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sojourner/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
