这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅skewr。
Bioconductor版本:3.11
skewr包是一个可视化的工具的输出Illumina公司人类甲基化450 k BeadChip帮助质量控制。它创建一个小组9块。六个情节代表密度的甲基化强度或unmethylated强度由三种探针总数485577的子集。你读这些子集包括类型,类型I-green和II型。其余三个分布给Beta-values的密度相同的三个子集。每个九块可选显示分布的“rs”SNP探针,探针与印迹基因相关的系列“滴答”标志上方的轴。
作者:瑞安帕特尼(cre, aut],史蒂文Eschrich (aut),安德斯·巴瑞(aut)
维护人员:瑞安帕特尼< ryanputney gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“skewr”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“skewr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“skewr”)
R脚本 | 介绍skewr包 | |
参考手册 |
biocViews | DNAMethylation,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(5.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.1.1),methylumi,西瓜,mixsmsn,IlluminaHumanMethylation450kmanifest |
进口 | minfi,S4Vectors(> = 0.19.1),RColorBrewer |
链接 | |
建议 | GEOquery,knitr,minfiData |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | skewr_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | skewr_1.20.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | skewr_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/skewr |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ skewr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/skewr/ |
包下载报告 | 下载数据 |