Singlecelltk
doi：10.18129/b9.bioc.singlecelltk
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅Singlecelltk。
单细胞RNA-seq数据的交互式分析
生物导体版本：3.11
直接通过浏览器运行常见的单细胞分析，包括差分表达，下采样分析和聚类。
作者：大卫·詹金斯
维护者：David Jenkins
引用（从r内，输入引用（“ singlecelltk”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ singlecelltk”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Singlecelltk”）
| html | R脚本 | 1. Singlecelltk简介 |
| html | R脚本 | 2.在单个单元工具包中处理和可视化数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，聚类，，，，差异性，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，Singlecell，，，，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（2。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.5），总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，延迟，，，，生物酶 |
| 进口 | 猿，，，，颜色，，，，簇，，，，复杂的图像，，，，Data.Table，，，，deseq2，，，，DT，，，，GGPLOT2，，，，格特里，，，，栅格，，，，GSVA（> = 1.26.0），GSVADATA，，，，林玛，，，，桅杆，，，，矩阵， 方法，多检验，，，，情节，，，，rcolorbrewer，，，，RTSNE，，，，S4VECTORS，，，，闪亮的，，，，Shinyjs，，，，丝绸，，，，SVA，，，，RESHAPE2，，，，AnnotationDbi，，，，Shinyalert，，，，循环，，，，富集，，，，塞尔达，，，，Shinycsssloaders，，，，有光泽的人，，，，UMAP |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，rsubread，，，，生物使用，，，，尼特，，，，林特，，，，BladderBatch，，，，rmarkDown，，，，org.mm.eg.db，，，，org.hs.eg.db，，，，scrnaseq，，，，Xtable，，，，拼写，，，，gseabase |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://compbiomed.github.io/sctk_docs/ |
| BugReports | https://github.com/compbiomed/singlecelltk/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | singlecelltk_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | singlecelltk_1.8.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | singlecelltk_1.8.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singlecelltk |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/singlecelltk |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/singlecelltk/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
