simpleaffy

DOI:10.18129 / B9.bioc.simpleaffy

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见simpleaffy

非常简单的Affymetrix数据的高级分析

Bioconductor版本:3.11

提供高级函数,用于读取Affy . cel文件、表型数据,然后用它计算简单的东西,如t检验、折叠变化等。大量使用affy库。还具有一些基本的散点图功能和机制,用于生成高分辨率的日志数字…

作者:Crispin J Miller

维护者:Crispin Miller

引文(从R内,输入引用(“simpleaffy”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("simpleaffy")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“simpleaffy”)

PDF R脚本 simpleaffy底漆
PDF 参考手册
文本 自述

细节

biocViews 注释DataImportDifferentialExpression微阵列OneChannel预处理质量控制ReportWriting软件转录可视化
版本 2.64.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 2.0.0),方法,utils, grDevices,图形,统计,BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobaseaffy(> = 1.33.6),genefiltergcrma
进口 方法,utils, grDevices,图形,统计,BiocGenericsBiobaseaffygenefiltergcrma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
全靠我 yaqcaffy
进口我 affyQCReportarrayMvout
建议我 AffyExpressArrayTools
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 simpleaffy_2.64.0.tar.gz
Windows二进制 simpleaffy_2.64.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) simpleaffy_2.64.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simpleaffy
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/simpleaffy
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/simpleaffy/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网