sigsquared

DOI:10.18129 / B9.bioc.sigsquared

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见sigsquared．

功能验证信号通路的基因签名生成

Bioconductor版本:3.11

通过利用由二元阈值定义的患者队列的统计特性(生存日志秩检验)，通过对成本函数的优化减少I型和II型误差，用sigsquared包识别预后不良的患者。

作者:UnJin Lee

维护者:UnJin Lee < UnJin at uchicago.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("sigsquared")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“sigsquared”)

PDF	R脚本	SigSquared
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(5.5年)
许可证	GPL版本3
取决于	R(>= 3.2.0)，方法
进口	Biobase，生存
链接
建议	RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	sigsquared_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	sigsquared_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	sigsquared_1.20.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigsquared
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sigsquared
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sigsquared/
软件包下载报告	下载数据