此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅siggenes。
生物导体版本:3.11
使用微阵列(SAM)的显着性分析和微阵列(EBAM)的经验贝叶斯分析,鉴定出差异表达的基因和错误发现率(FDR)的估计。
作者:Holger Schwender
维护者:Holger Schwender
引用(从r内,输入引用(“ Siggenes”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ siggenes”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Siggenes”)
html | 识别.sam.html | |
html | plot.ebam.html | |
html | plot.finda0.html | |
html | plot.sam.html | |
html | print.ebam.html | |
html | print.finda0.html | |
html | print.sam.html | |
R脚本 | Siggenes手册 | |
siggenesrnews.pdf | ||
html | summary.ebam.html | |
html | summary.sam.html | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,exonarray,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,SNP,,,,软件 |
版本 | 1.62.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15.5岁) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | 生物酶,,,,多检验,花键,方法 |
进口 | Stats4,Grdevices,Graphics,Stats,scrime(> = 1.2.5) |
链接 | |
建议 | 副词,,,,注释,,,,GeneFilter,,,,克恩斯门茶 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | KCSMART |
进口我 | coexnet,,,,达帕尔,,,,Desousa2013,,,,Minfi,,,,三人组,,,,XDE |
建议我 | GCSSCORE,,,,逻辑 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | siggenes_1.62.0.tar.gz |
Windows二进制 | siggenes_1.62.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | siggenes_1.62.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/siggenes |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/ |
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