shinyMethyl

DOI:10.18129 / B9.bioc.shinyMethyl

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅shinyMethyl。

交互式可视化的Illumina公司甲基化数组

Bioconductor版本:3.11

交互式可视化的工具Illumina公司甲基化数组的数据。支持450 k和史诗数组。

作者:让-菲利普•福丁(cre, aut], Kasper丹尼尔·汉森(aut)

维护人员:让-菲利普•福丁< jfortin jhsph.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“shinyMethyl”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“shinyMethyl”)

PDF	R脚本	shinyMethyl:交互式的可视化Illumina公司450 k甲基化数组
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文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),闪亮的(> = 0.13.2),minfi(> = 1.18.2),IlluminaHumanMethylation450kmanifest,matrixStatsR (> = 3.0.0)
进口	RColorBrewer
链接
建议	shinyMethylData,minfiData,BiocStyle,RUnit,消化,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	shinyMethyl_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	shinyMethyl_1.24.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	shinyMethyl_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/shinyMethyl
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ shinyMethyl
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethyl/
包下载报告	下载数据