芝麻

DOI:10.18129 / B9.bioc.sesame

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅芝麻

工具分析Illumina公司英飞纳姆DNA甲基化数组

Bioconductor版本:3.11

工具分析Illumina公司英飞纳姆DNA甲基化数组。

作者:周扫读(aut (cre),回族沈(aut),盖Triche[所有],布雷特·巴恩斯(施)

维护人员:扫读周< zhouwanding gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“芝麻”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“芝麻”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“芝麻”)

HTML R脚本 0。芝麻用户指南
HTML R脚本 1。质量控制
HTML R脚本 2。大数据
HTML R脚本 3所示。Minfi交互
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DNAMethylation,MethylationArray,预处理,质量控制,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.8 (r - 3.5)(2年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 3.6),sesameData、方法
进口 BiocParallelgrDevices跑龙套,illuminaio,质量,GenomicRanges,IRanges、网格preprocessCore统计数据,S4Vectors,randomForest,wheatmap,ggplot2平行,matrixStats,DNAcopy,HDF5Array,SummarizedExperiment
链接
建议 尺度,knitr,rmarkdown,testthat,minfi,FlowSorted.CordBloodNorway.450k,FlowSorted.Blood.450k,dplyr,tidyr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/zwdzwd/sesame
BugReports https://github.com/zwdzwd/sesame/issues
取决于我
进口我 TCGAbiolinksGUI
建议我 sesameData,TCGAbiolinks
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 sesame_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 sesame_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉) sesame_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesame
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/芝麻
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/sesame/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网