Sapfinder
doi：10.18129/b9.bioc.sapfinder
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅Sapfinder。
用于shot弹枪蛋白质组学中变异肽检测和可视化的软件包。
生物导体版本：3.11
Sapfinder的开发是为了自动化（1）变体相关的数据库构建，（2）数据库搜索，（3）后处理，（4）基于HTML的shot弹枪蛋白质组学中基于HTML的报告生成。
作者：Shaohang Xu，Bo Wen
维护者：shaohang xu
引用（从r内，输入引用（“ Sapfinder”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ sapfinder”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Sapfinder”）
| R脚本 | Sapfinder小插图 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 免疫学，，，，质谱，，，，蛋白质组学，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，SNP，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.0.0），rtandem（> = 1.3.5） |
| 进口 | pheatmap，，，，RCPP（> = 0.10.6），图形，grdevices，stats，utils |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | sapfinder_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | sapfinder_1.26.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | sapfinder_1.26.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sapfinder |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/sapfinder |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/sapfinder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
