runibic

DOI:10.18129 / B9.bioc.runibic

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见runibic．

runibic:用于分析R中基因表达数据的基于行的聚类算法

Bioconductor版本:3.11

这个包在r中实现了UbiBic算法。这个用于分析基因表达数据的聚类算法是由Zhenjia Wang等人在2016年引入的。它目前被认为是在复杂和噪声数据中最有前途的有意义结构识别的聚类方法。

作者:Patryk Orzechowski, Artur pazynczyk

维护者:Patryk Orzechowski < Patryk。Orzechowski在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“runibic”)

超文本标记语言		runibic: R教程中的UniBic
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，报道，GeneExpression，微阵列，测序，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(3年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4.0)，biclust，SummarizedExperiment
进口	Rcpp(> = 0.12.12),testthat、方法
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，GEOquery，affy，气道，QUBIC
SystemRequirements	c++ 11, GNU制作
增强了
URL	http://github.com/athril/runibic
BugReports	http://github.com/athril/runibic/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	runibic_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	runibic_1.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/runibic
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/runibic
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/runibic/
软件包下载报告	下载数据