此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rrvgo.
Bioconductor版本:3.11
通过基于语义相似性识别冗余,减少和可视化基因本体术语列表。
作者:Sergi Sayols
维护者:Sergi Sayols
引文(从R内,输入引用(“rrvgo”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rrvgo")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rrvgo”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用rrvgo |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,聚类,去,网络,通路,软件 |
版本 | 1.0.2中 |
在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(0.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | GOSemSim,AnnotationDbi,GO.db,pheatmap,ggplot2,ggrepel,treemap,tm,wordcloud,闪亮的, grDevices,网格,统计,方法 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat(> =魅惑,shinydashboard,DT,情节,的热图,magrittr跑龙套,clusterProfiler,剂量,大满贯,org.Ag.eg.db,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.Pf.plasmo.db,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,org.Ss.eg.db,org.Xl.eg.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rrvgohttps://ssayols.github.io/rrvgo/index.html |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | rrvgo_1.0.2.tar.gz |
Windows二进制 | rrvgo_1.0.2.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | rrvgo_1.0.2.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rrvgo |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rrvgo |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rrvgo/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |