rfaRm

DOI:10.18129 / B9.bioc.rfaRm

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rfaRm

R Rfam数据库接口

Bioconductor版本:3.11

rfaRm Rfam数据库提供了一个客户端接口的RNA的家庭。可以检索数据,包括RNA家庭,二级结构图像,协方差模型、序列在每个家庭中,排列导致一个家庭的识别和二级结构的dot-bracket格式。

作者:劳拉出售比达尔,拉斐尔•阿亚拉Guy-Bart斯坦,罗德里戈Ledesma-Amaro

维修工:劳拉出售比达尔<劳拉。selles12 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala < r。在imperial.ac.uk ayala14 >

从内部引用(R,回车引用(“rfaRm”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rfaRm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rfaRm”)

HTML R脚本 rfaRm
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,FunctionalGenomics,MultipleSequenceAlignment,软件,ThirdPartyClient,可视化
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 httr,stringi,rsvg,魔法,data.table,Biostrings,跑龙套
链接
建议 R4RNA,treeio,knitr,BiocStyle,rmarkdown,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 rfaRm_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 rfaRm_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉) rfaRm_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfaRm
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rfaRm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rfaRm/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网