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rfaRm
DOI:10.18129 / B9.bioc.rfaRm
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rfaRm。
R Rfam数据库接口
Bioconductor版本:3.11
rfaRm Rfam数据库提供了一个客户端接口的RNA的家庭。可以检索数据,包括RNA家庭,二级结构图像,协方差模型、序列在每个家庭中,排列导致一个家庭的识别和二级结构的dot-bracket格式。
作者:劳拉出售比达尔,拉斐尔•阿亚拉Guy-Bart斯坦,罗德里戈Ledesma-Amaro
维修工:劳拉出售比达尔<劳拉。selles12 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala < r。在imperial.ac.uk ayala14 >
从内部引用(R,回车引用(“rfaRm”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rfaRm”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“rfaRm”)
| HTML | R脚本 | rfaRm |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport,FunctionalGenomics,MultipleSequenceAlignment,软件,ThirdPartyClient,可视化 |
| 版本 | 1.0.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | httr,stringi,rsvg,魔法,data.table,Biostrings,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | R4RNA,treeio,knitr,BiocStyle,rmarkdown,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | rfaRm_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rfaRm_1.0.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | rfaRm_1.0.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfaRm |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rfaRm |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rfaRm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
