rBiopaxParser

DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rBiopaxParser

解析BioPax文件并用R表示

Bioconductor版本:3.11

解析BioPAX文件并用R表示,目前支持BioPAX级别2和级别3。

作者:弗兰克·克莱默

维护者:Frank Kramer

引文(从R内,输入引用(“rBiopaxParser”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rBiopaxParser")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rBiopaxParser”)

PDF R脚本 rBiopaxParser装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation软件
版本 2.28.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(7.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.0.0),data.table
进口 XML
链接
建议 RgraphvizRCurlRUnitBiocGenericsnemRBGLigraph
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser
全靠我
进口我 AnnotationHubDatapwOmics
建议我 AnnotationHubNetPathMiner
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 rBiopaxParser_2.28.0.tar.gz
Windows二进制 rBiopaxParser_2.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) rBiopaxParser_2.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rBiopaxParser
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rBiopaxParser/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网