此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rBiopaxParser.
Bioconductor版本:3.11
解析BioPAX文件并用R表示,目前支持BioPAX级别2和级别3。
作者:弗兰克·克莱默
维护者:Frank Kramer
引文(从R内,输入引用(“rBiopaxParser”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rBiopaxParser")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rBiopaxParser”)
R脚本 | rBiopaxParser装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,软件 |
版本 | 2.28.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(7.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.0.0),data.table |
进口 | XML |
链接 | |
建议 | Rgraphviz,RCurl,图,RUnit,BiocGenerics,nem,RBGL,igraph |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser |
全靠我 | |
进口我 | AnnotationHubData,pwOmics |
建议我 | AnnotationHub,NetPathMiner |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | rBiopaxParser_2.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | rBiopaxParser_2.28.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | rBiopaxParser_2.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rBiopaxParser |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rBiopaxParser/ |
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