qckitfastq

DOI:10.18129 / B9.bioc.qckitfastq

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qckitfastq。

FASTQ质量控制

Bioconductor版本:3.11

评估FASTQ文件格式与多个指标包括质量分数、序列的内容,过多和Kmers序列。

作者:Wenyue兴(aut),光(aut (cre) 8月

维修工:8月广< 8月。光在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“qckitfastq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“qckitfastq”)

PDF	R脚本	使用qckitfastq质量控制分析和可视化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	质量控制,测序,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	magrittr,ggplot2,dplyr,seqTools,zlibbioc,data.table,reshape2grDevices图形,统计,跑龙套,Rcpp,rlang,RSeqAn
链接	Rcpp,RSeqAn
建议	knitr,rmarkdown,kableExtra,testthat
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	qckitfastq_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	qckitfastq_1.4.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	qckitfastq_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qckitfastq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qckitfastq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/qckitfastq/
包下载报告	下载数据