此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pulsedSilac.
Bioconductor版本:3.11
这个包提供了一些用于脉冲silac数据分析的工具。提供了组织数据、计算同位素比率、同位素分数、建模蛋白质周转、比较周转模型、估计细胞生长和估计同位素循环的功能。还包括一些可视化工具来进行基本的数据探索、质量控制、条件比较、单个模型检查和模型比较。
作者:Marc Pagès-Gallego, Tobias B. Dansen
维护者:Marc Pagès-Gallego
引文(从R内,输入引用(“pulsedSilac”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pulsedSilac")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“pulsedSilac”)
超文本标记语言 | R脚本 | 脉冲silac数据分析 |
参考手册 |
biocViews | 蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | bio3.10 (R-3.6)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6.0) |
进口 | robustbase、方法、R.utils,taRifx,S4Vectors,SummarizedExperiment,ggplot2,ggridges,统计,utils,UpSetR,cowplot、网格MuMIn |
链接 | |
建议 | testthat(> =魅惑,knitr,rmarkdown,gridExtra |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | pulsedSilac_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | pulsedSilac_1.2.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | pulsedSilac_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pulsedSilac |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pulsedSilac |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pulsedSilac/ |
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