pulsedSilac

DOI:10.18129 / B9.bioc.pulsedSilac

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pulsedSilac

脉冲- silac定量蛋白质组学数据分析

Bioconductor版本:3.11

这个包提供了一些用于脉冲silac数据分析的工具。提供了组织数据、计算同位素比率、同位素分数、建模蛋白质周转、比较周转模型、估计细胞生长和估计同位素循环的功能。还包括一些可视化工具来进行基本的数据探索、质量控制、条件比较、单个模型检查和模型比较。

作者:Marc Pagès-Gallego, Tobias B. Dansen

维护者:Marc Pagès-Gallego

引文(从R内,输入引用(“pulsedSilac”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pulsedSilac")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“pulsedSilac”)

超文本标记语言 R脚本 脉冲silac数据分析
PDF 参考手册

细节

biocViews 蛋白质组学软件
版本 1.2.0
在Bioconductor bio3.10 (R-3.6)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.6.0)
进口 robustbase、方法、R.utilstaRifxS4VectorsSummarizedExperimentggplot2ggridges,统计,utils,UpSetRcowplot、网格MuMIn
链接
建议 testthat(> =魅惑,knitrrmarkdowngridExtra
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 pulsedSilac_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 pulsedSilac_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) pulsedSilac_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pulsedSilac
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pulsedSilac
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/pulsedSilac/
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