proteoQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.proteoQC

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅proteoQC。

为蛋白质组学数据质量控制R包

Bioconductor版本:3.11

这个包创建一个HTML格式QC报告/女士MS-based蛋白质组学数据。这份报告的目的是允许用户快速评估蛋白质组学数据的质量。

作者:博温家宝<文博genomics.cn >。劳伦与< lg390在cam.ac.uk >

维护人员:Bo温家宝<文博genomics.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“proteoQC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,ReportWriting,软件,可视化
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(6年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 3.0.0),XML,维恩图,MSnbase
进口	rTANDEM,plyr,seqinr,Nozzle.R1,ggplot2,reshape2平行,rpx,tidyr,dplyr,情节,rmarkdown
链接
建议	RforProteomics,knitr,BiocStyle,R.utils,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/wenbostar/proteoQC
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proteoQC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ proteoQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/proteoQC/
包下载报告	下载数据