procoil

DOI:10.18129 / B9.bioc.procoil

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见procoil

卷曲卷曲蛋白的寡聚化预测

Bioconductor版本:3.11

该包允许预测是否卷曲线圈序列(氨基酸序列加上七轴位寄存器)更有可能形成二聚体或更有可能形成三聚体。除了预测本身之外,还计算了一个预测轮廓,该轮廓允许确定单个残差对任何一类的指示强度。预测曲线也可以可视化为曲线或热图。

作者:乌尔里希·博登霍费尔

维护者:Ulrich Bodenhofer < Bodenhofer at bioinf.jku.at>

引用(来自R,输入引用(“procoil”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("procoil")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“procoil”)

PDF R脚本 PrOCoil -一个Web服务和R包,用于预测卷曲卷曲蛋白的寡聚化
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类蛋白质组学软件SupportVectorMachine
版本 2.16.0
在Bioconductor中 BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.3.0),烤肉串
进口 方法,统计,图形,S4VectorsBiostrings,跑龙套
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinf.jku.at/software/procoil/https://github.com/UBod/procoil
这取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 procoil_2.16.0.tar.gz
Windows二进制 procoil_2.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) procoil_2.16.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/procoil
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/procoil
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/procoil/
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