该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见procoil.
Bioconductor版本:3.11
该包允许预测是否卷曲线圈序列(氨基酸序列加上七轴位寄存器)更有可能形成二聚体或更有可能形成三聚体。除了预测本身之外,还计算了一个预测轮廓,该轮廓允许确定单个残差对任何一类的指示强度。预测曲线也可以可视化为曲线或热图。
作者:乌尔里希·博登霍费尔
维护者:Ulrich Bodenhofer < Bodenhofer at bioinf.jku.at>
引用(来自R,输入引用(“procoil”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("procoil")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“procoil”)
R脚本 | PrOCoil -一个Web服务和R包,用于预测卷曲卷曲蛋白的寡聚化 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,蛋白质组学,软件,SupportVectorMachine |
版本 | 2.16.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.3.0),烤肉串 |
进口 | 方法,统计,图形,S4Vectors,Biostrings,跑龙套 |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bioinf.jku.at/software/procoil/https://github.com/UBod/procoil |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | procoil_2.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | procoil_2.16.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | procoil_2.16.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/procoil |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/procoil |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/procoil/ |
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