proDA

DOI:10.18129 / B9.bioc.proDA

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅proDA。

微分丰富Label-Free质谱数据的分析

Bioconductor版本:3.11

占label-free质谱数据中的缺失值没有污名。包实现了一个辍学概率模型,确保信息正确观察和缺失值的总和。它增加了经验贝叶斯先验增加功率检测不同的丰富的蛋白质。

作者:江诗丹顿Ahlmann-Eltze (aut (cre)西蒙·安德斯(黑色)

维护人员:江诗丹顿Ahlmann-Eltze < artjom31415 googlemail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“proDA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	数据导入
HTML	R脚本	介绍
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文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,DifferentialExpression,MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,质量控制,回归,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	统计,跑龙套、方法BiocGenerics,SummarizedExperiment,S4Vectors,extraDistr
链接
建议	testthat(> =魅惑,MSnbase,dplyr,stringr,readr,tidyr,宠物猫,limma,部,numDeriv,pheatmap,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/const-ae/proDA
BugReports	https://github.com/const-ae/proDA/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	proDA_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	proDA_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	proDA_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proDA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ proDA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/proDA/
包下载报告	下载数据