钢琴

DOI:10.18129 / B9.bioc.piano

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见钢琴

组学数据综合分析平台

Bioconductor版本:3.11

Piano使用各种统计方法进行基因集分析,从不同的基因水平统计和广泛的基因集集合。此外,Piano包包含组合多个运行的基因集分析结果的功能。

作者:Leif Varemo Wigge <钢琴。RPKG在gmail.com>而且Intawat Nookaew

维护者:Leif Varemo Wigge <钢琴。RPKG在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(钢琴)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("piano")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(钢琴)

PDF R脚本 组学数据综合分析平台
超文本标记语言 R脚本 用钢琴进行基因组分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionGeneSetEnrichment微阵列通路预处理质量控制软件可视化
版本 测试盒框
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(7.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.5)
进口 BiocGenericsBiobasegplotsigraph关系marrayfgsea闪亮的DThtmlwidgetsshinyjsshinydashboardvisNetwork尺度, grDevices,图形,统计,utils,方法
链接
建议 yeast2.dbrsbmlplotrixlimmaaffy钳子affyPLMgtoolsbiomaRt降雪AnnotationDbiknitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL http://www.sysbio.se/piano
BugReports https://github.com/varemo/piano/issues
全靠我
进口我 CoreGx
建议我 BloodCancerMultiOmics2017
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 piano_2.4.0.tar.gz
Windows二进制 piano_2.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) piano_2.4.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/piano
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/piano
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/piano/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网