此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅表。
生物导体版本:3.11
以高效,结构化,快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间相关性的工具。还提供了GSEA。
作者:evarist星球
维护者:evarist星球
引用(从r内,输入引用(“表巨人”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ phenotest”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“表巨人”)
R脚本 | 表格最图书馆的手册 | |
参考手册 |
生物浏览 | 分类,,,,聚类,,,,差异性,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,软件 |
版本 | 1.36.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(9。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.12.0),生物酶, 方法,注释,,,,热倍,,,,BMA,,,,GGPLOT2,,,,HMISC |
进口 | 生存,,,,林玛,,,,GPLOTS,,,,类别,,,,AnnotationDbi,,,,霍巴赫,,,,Biomart,,,,gseabase,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,注释,,,,MGCV,,,,HGU133A.DB,,,,椭圆 |
链接 | |
建议 | gseabase,,,,kegg.db,,,,go.db |
系统要求 | |
增强 | 平行,org.ce.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,org.dm.eg.db |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 癌症 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Phanotest_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | PANTOTEST_1.36.0.ZIP |
MacOS 10.13(高山脉) | PANTOTEST_1.36.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenotest |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/表格 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/phenotest/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |