doi:10.18129/b9.bioc.phenotest

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅

以高效,结构化,快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间关联的工具。我们还提供了进行GSEA(基因集富集分析)和拷贝数变化的工具。

生物导体版本:3.11

以高效,结构化,快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间相关性的工具。还提供了GSEA。

作者:evarist星球

维护者:evarist星球

引用(从r内,输入引用(“表巨人”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ phenotest”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“表巨人”)

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细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,差异性,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,软件
版本 1.36.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(9。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.12.0),生物酶, 方法,注释,,,,热倍,,,,BMA,,,,GGPLOT2,,,,HMISC
进口 生存,,,,林玛,,,,GPLOTS,,,,类别,,,,AnnotationDbi,,,,霍巴赫,,,,Biomart,,,,gseabase,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,注释,,,,MGCV,,,,HGU133A.DB,,,,椭圆
链接
建议 gseabase,,,,kegg.db,,,,go.db
系统要求
增强 平行,org.ce.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,org.dm.eg.db
URL
取决于我
进口我 癌症
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Phanotest_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 PANTOTEST_1.36.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) PANTOTEST_1.36.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenotest
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/表格
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/phenotest/
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