此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见phemd.
Bioconductor版本:3.11
包,用于比较和生成多个单细胞样本的低维嵌入。
作者:William S Chen
维护者:William S Chen < will .yum。陈在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“phemd”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("phemd")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“phemd”)
超文本标记语言 | R脚本 | PhEMD装饰图案 |
参考手册 |
biocViews | 聚类,ComparativeGenomics,DataRepresentation,DimensionReduction,MultipleComparison,蛋白质组学,测序,SingleCell,软件,转录组,可视化 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(1.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.5),单片眼镜 |
进口 | SingleCellExperiment,RColorBrewer,igraph,运输,pracma,集群,Rtsne,命运,修拉,RANN,ggplot2,maptree,pheatmap,scatterplot3d,VGAM,方法,grDevices,图形,统计,utils,cowplot,S4Vectors,BiocGenerics,SummarizedExperiment,Biobase,酷毙了,网状 |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | phemd_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | phemd_1.4.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | phemd_1.4.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phemd |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/phemd |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phemd/ |
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