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此包适用于Bioconductor 3.11版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见pcaGoPromoter.
Bioconductor版本:3.11
该软件包包含简化DNA微阵列分析的功能。它利用主成分分析作为初始的多变量分析,然后对主成分维度进行功能解释,对GO术语进行过度表示分析,并使用素数算法对预测的转录因子结合位点进行过度表示分析。
作者:莫滕·汉森,约根·奥尔森
维护者:Morten Hansen
引文(从R内,输入引用(“pcaGoPromoter”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pcaGoPromoter")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | 去,GeneExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.32.0 |
在Bioconductor | BioC 2.10 (R-2.15)(8.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.14.0),椭圆,Biostrings |
进口 | AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | Rgraphviz,GO.db,hgu133plus2.db,mouse4302.db,rat2302.db,hugene10sttranscriptcluster.db,mogene10sttranscriptcluster.db,pcaGoPromoter.Hs.hg19,pcaGoPromoter.Mm.mm9,pcaGoPromoter.Rn.rn4,serumStimulation、并行 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaGoPromoter |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pcaGoPromoter |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pcaGoPromoter/ |
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