此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见panp.
Bioconductor版本:3.11
基于与负链匹配探针集(NSMP)的距离进行基因存在/缺失调用的函数,该函数源自Affymetrix注释。PANP是在创建基因表达值之后应用的,因此可以在任何预处理方法(如MAS5或GCRMA)或仅pm方法(如RMA)之后使用。到目前为止,已经为HGU133A和HGU133-Plus-2.0芯片组建立了NSMP集。
作者:彼得·沃伦
维护者:Peter Warren < Peter。Warren在verizon.net>上
引文(从R内,输入引用(panp)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (panp)
R脚本 | 基因的存在/缺席呼叫 | |
参考手册 |
biocViews | 基础设施,软件 |
版本 | 1.58.0 |
在Bioconductor | BioC 1.8 (R-2.3)(14.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.10),affy(> = 1.23.4),Biobase(> = 2.5.5) |
进口 | Biobase,方法,统计,utils |
链接 | |
建议 | gcrma |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | panp_1.58.0.tar.gz |
Windows二进制 | panp_1.58.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | panp_1.58.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panp |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/panp |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/panp/ |
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