此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅OPPAR。
生物导体版本:3.11
Wang等人发布的MCOPA软件包的R实施。(2012)。OPPAR提供了癌症异常值分析的方法。尽管最初开发用于检测癌症研究中的异常基因,但OPPAR中提出的方法通常用于总体分析分析。此外,还为基因集富集和途径分析提供了工具。
作者:Chenwei Wang [Aut],Alperen Taciroglu [Aut],Stefan R Maetschke [AUT],Colleen C Nelson [Aut],Mark Ragan [Aut],Melissa Davis [aut],Soroor Hediyeeh Zadeh [Cree],Momeneh foroutan [Cretan foroutan [CTR]
维护者:soroor hediyeh zadeh
引用(从r内,输入引用(“ oppar”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ oppar”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ oppar”)
html | R脚本 | OPPAR:R中的离群值和途径分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,基因烯,,,,途径,,,,软件,,,,系统生物学 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 3.3) |
进口 | 生物酶, 方法,gseabase,,,,GSVA |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,林玛,,,,org.hs.eg.db,,,,go.db,,,,雪, 平行 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | oppar_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | OPPAR_1.16.0.ZIP(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | OPPAR_1.16.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oppar |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/oppar |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/oppar/ |
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