OPPAR

doi:10.18129/b9.bioc.oppar

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅OPPAR

R中的离群值和途径分析

生物导体版本:3.11

Wang等人发布的MCOPA软件包的R实施。(2012)。OPPAR提供了癌症异常值分析的方法。尽管最初开发用于检测癌症研究中的异常基因,但OPPAR中提出的方法通常用于总体分析分析。此外,还为基因集富集和途径分析提供了工具。

作者:Chenwei Wang [Aut],Alperen Taciroglu [Aut],Stefan R Maetschke [AUT],Colleen C Nelson [Aut],Mark Ragan [Aut],Melissa Davis [aut],Soroor Hediyeeh Zadeh [Cree],Momeneh foroutan [Cretan foroutan [CTR]

维护者:soroor hediyeh zadeh

引用(从r内,输入引用(“ oppar”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ oppar”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ oppar”)

html R脚本 OPPAR:R中的离群值和途径分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,基因烯,,,,途径,,,,软件,,,,系统生物学
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.3)
进口 生物酶, 方法,gseabase,,,,GSVA
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,林玛,,,,org.hs.eg.db,,,,go.db,,,,, 平行
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 oppar_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 OPPAR_1.16.0.ZIP(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) OPPAR_1.16.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oppar
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/oppar
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/oppar/
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