opencyto

doi:10.18129/b9.bioc.opencyto

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅opencyto

流式细胞仪数据的分层门控管道

生物导体版本:3.11

该软件包旨在以顺序的方式促进自动门控方法,以模仿手动门通策略。

作者:Mike Jiang,John Ramey,Greg Finak,Raphael Gottardo

维护者:Mike Jiang

引用(从r内,输入引用(“ opencyto”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ opencyto”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ opencyto”)

html R脚本 OpencyTo软件包的简介
html R脚本 如何使用不同的自动门控功能
html R脚本 如何编写CSV板模板
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,流程仪,,,,免疫学,,,,预处理,,,,软件
版本 2.0.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(7年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5.0)
进口 方法,生物酶,,,,生物基因,,,,gtools,,,,流核(> = 1.99.17),Flowviz,,,,ncdfflow(> = 2.11.34),FlowWorkspace(> = 3.99.1),FlowStats(> = 3.99.1),flowclust(> = 3.11.4),大量的,,,,线索,,,,plyr,,,,rbgl,,,,图形,,,,Data.Table,,,,KS,,,,rcolorbrewer,,,,格子,,,,rrcov,,,,r.utils
链接 RCPP
建议 FlowWorkspacedata,,,,尼特,,,,测试,utils,工具,并行,ggcyto,,,,细胞瘤
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 细胞瘤
建议我 催化剂,,,,flowclust,,,,流核,,,,FlowStats,,,,FlowWorkspace,,,,ggcyto
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 opencyto_2.0.0.tar.gz
Windows二进制 opencyto_2.0.0.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) opencyto_2.0.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/opencyto
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/opencyto
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/opencyto//
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