netbenchmark

DOI:10.18129 / B9.bioc.netbenchmark

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅netbenchmark。

基准测试的几个基因网络推理方法

Bioconductor版本:3.11

这个方案实现了一个基准测试的几个基因网络推理算法从基因表达数据。

作者:保罗Bellot Catharina奥尔森,帕特里克·迈耶

维护人员:加索尔Bellot <加索尔。在upc.edu bellot >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“netbenchmark”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“netbenchmark”)

HTML	R脚本	Netbenchmark
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression,GraphAndNetwork,微阵列,网络,NetworkInference,软件
版本	1.19.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(5.5年)
许可证	CC BY-NC-SA 4.0
取决于	grndata(> = 0.99.3)
进口	Rcpp(> = 0.11.0)它,minet,GENIE3,c3netPCIT,GeneNet、工具、pracma,矩阵,corpcor,fdrtool
链接	Rcpp
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr,图
SystemRequirements
增强了
URL	https://imatge.upc.edu/netbenchmark/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	netbenchmark_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	netbenchmark_1.19.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netbenchmark
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ netbenchmark
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/netbenchmark/
包下载报告	下载数据