此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅多检验。
生物导体版本:3.11
非参数引导程序和置换基于重新采样的多个测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制家庭错误率(FWER),概括性家庭错误率(GFWER),误差(TPPFP的比例)(TPPFP的比例))和错误的发现率(FDR)。实现了基于自举的无效分布的几种选择(中心,居中和缩放,分位数转换)。提供单步和阶梯方法。包括基于多种T和F统计量的测试(包括基于线性和生存模型的回归参数以及基于相关参数的T统计量)。当用T统计数据探测假设时,用户还可以选择一个潜在的更快的无效分布,该分布是多变量正常的,平均零和差异协方差矩阵源自矢量影响函数。结果是根据调整后的P值,置信区和测试统计截止的报告。该过程直接适用于在DNA微阵列实验中鉴定差异表达的基因。
作者:Katherine S. Pollard,休斯顿N. Gilbert,Yongchao GE,Sandra Taylor,Sandrine Dudoit
维护者:Katherine S. Pollard
引用(从r内,输入引用(“多检验”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ multytest”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,软件 |
版本 | 2.44.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15.5岁) |
执照 | LGPL |
要看 | R(> = 2.10),方法,生物基因,,,,生物酶 |
进口 | 生存,,,,大量的,Stats4 |
链接 | |
建议 | 雪 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | A4base,,,,ACGH,,,,Bicare,,,,IPAC,,,,KCSMART,,,,lmgene,,,,preda,,,,雨,,,,redseq,,,,sagx,,,,siggenes,,,,Webbioc |
进口我 | Abarray,,,,adsplit,,,,ALDEX2,,,,Anota,,,,anota2seq,,,,Chippeakanno,,,,异种态,,,,Knowseq,,,,MAPKL,,,,化合物,,,,nethet,,,,Ocplus,,,,门索,,,,rtopper,,,,Singlecellsignalr,,,,Singlecelltk,,,,突触,,,,Webbioc |
建议我 | 安菲,,,,生物探测,,,,Ecolitk,,,,事实设计,,,,ggtools,,,,gostats,,,,gqtlstats,,,,gsealm,,,,迈格巴克,,,,mmpalatemirna,,,,PCOT2,,,,ropls,,,,topgo,,,,XCMS |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | MULTTEST_2.44.0.TAR.GZ |
Windows二进制 | multtest_2.44.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | MULTTEST_2.44.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multtest |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/multytest |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/multtest/ |
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