多检验

doi:10.18129/b9.bioc.multtest

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅多检验

基于重采样的多个假设检验

生物导体版本:3.11

非参数引导程序和置换基于重新采样的多个测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制家庭错误率(FWER),概括性家庭错误率(GFWER),误差(TPPFP的比例)(TPPFP的比例))和错误的发现率(FDR)。实现了基于自举的无效分布的几种选择(中心,居中和缩放,分位数转换)。提供单步和阶梯方法。包括基于多种T和F统计量的测试(包括基于线性和生存模型的回归参数以及基于相关参数的T统计量)。当用T统计数据探测假设时,用户还可以选择一个潜在的更快的无效分布,该分布是多变量正常的,平均零和差异协方差矩阵源自矢量影响函数。结果是根据调整后的P值,置信区和测试统计截止的报告。该过程直接适用于在DNA微阵列实验中鉴定差异表达的基因。

作者:Katherine S. Pollard,休斯顿N. Gilbert,Yongchao GE,Sandra Taylor,Sandrine Dudoit

维护者:Katherine S. Pollard

引用(从r内,输入引用(“多检验”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ multytest”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,软件
版本 2.44.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15.5岁)
执照 LGPL
要看 R(> = 2.10),方法,生物基因,,,,生物酶
进口 生存,,,,大量的,Stats4
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 A4base,,,,ACGH,,,,Bicare,,,,IPAC,,,,KCSMART,,,,lmgene,,,,preda,,,,,,,,redseq,,,,sagx,,,,siggenes,,,,Webbioc
进口我 Abarray,,,,adsplit,,,,ALDEX2,,,,Anota,,,,anota2seq,,,,Chippeakanno,,,,异种态,,,,Knowseq,,,,MAPKL,,,,化合物,,,,nethet,,,,Ocplus,,,,门索,,,,rtopper,,,,Singlecellsignalr,,,,Singlecelltk,,,,突触,,,,Webbioc
建议我 安菲,,,,生物探测,,,,Ecolitk,,,,事实设计,,,,ggtools,,,,gostats,,,,gqtlstats,,,,gsealm,,,,迈格巴克,,,,mmpalatemirna,,,,PCOT2,,,,ropls,,,,topgo,,,,XCMS
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 MULTTEST_2.44.0.TAR.GZ
Windows二进制 multtest_2.44.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) MULTTEST_2.44.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multtest
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/multytest
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/multtest/
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