这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅multiClust。
Bioconductor版本:3.11
聚类识别模式进行转录组配置文件来确定病人的临床相关的子组。特性(基因)选择是一个关键的和过程的一个组成部分。目前,有许多特征选择和聚类方法来确定样本的相关基因并执行聚类。然而,选择一个合适的方法是很困难的。此外,广泛的特征选择方法尚未支持的可用包。因此,我们开发了一个综合R-package叫multiClust允许研究人员试验相结合的方法的选择基因选择和集群轻松。使用multiClust,我们确定表现最佳的聚类方法在临床结果。我们的观察表明,简单的方法如variance-based排名表现良好在大多数数据集,提供适当数量的基因被选中。然而,不同的基因排序和选择方法仍然没有方法适用于所有相关研究。
作者:内森软件(aut (cre) Peiyong关(aut),亚历克Fabbri (aut) Krish Karuturi (aut) Joshy乔治(aut)
维护人员:内森Lawlor <内森。在gmail.com lawlor03 >
从内部引用(R,回车引用(“multiClust”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“multiClust”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“multiClust”)
HTML | R脚本 | multiClust指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,FeatureExtraction,GeneExpression,软件,生存 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(4.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | mclust,ctc,生存,集群,dendextend,北极监测和评估方案、图形grDevices |
链接 | |
建议 | knitr,gplots,RUnit,BiocGenerics,preprocessCore,Biobase,GEOquery |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | multiClust_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | multiClust_1.18.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | multiClust_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiClust |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ multiClust |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/multiClust/ |
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