motifRG

DOI:10.18129 / B9.bioc.motifRG

此包适用于Bioconductor 3.11版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见motifRG

为高通量测序数据集设计的鉴别motif发现包

Bioconductor版本:3.11

使用回归方法鉴别母题发现的工具

作者:姚紫珍

维护者:姚紫珍< yzizen at fhcrc.org>

引文(从R内,输入引用(“motifRG”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("motifRG")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“motifRG”)

PDF R脚本 motifRG:基于回归的判别母题发现
PDF 参考手册

细节

biocViews MotifDiscovery软件转录
版本 1.31.0
在Bioconductor BioC 2.10 (R-2.15)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.15),Biostrings(> = 2.26),IRangesseqLogo,并行,方法,网格,图形,BSgenomeXVectorBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
进口 BiostringsIRangesseqLogo,并行,方法,网格,图形,XVector
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 motifRG_1.31.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifRG
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/motifRG
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/motifRG/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网