马赛克

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaics

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅马赛克

马赛克(基于模型的一个和两个样品分析和推理ChIP-Seq)

Bioconductor版本:3.11

这个包提供了函数拟合马赛克和MOSAiCS-HMM,统计框架来分析一个样品或两个示例ChIP-seq转录因子的数据绑定和组蛋白修饰。

作者:东峻涌裴分矿,Rene韦尔奇,Sunduz凯尔

维护人员:东峻涌<东峻。钟在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“马赛克”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“马赛克”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“马赛克”)

PDF R脚本 马赛克
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学,ChIPseq,遗传学,测序,软件,转录
版本 2.26.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(9.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(> = 3.0.0)、方法、图形、Rcpp
进口 质量样条函数,晶格,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,GenomeInfoDb,S4Vectors
链接 Rcpp
建议 mosaicsExample
SystemRequirements Perl
增强了 平行
URL http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 mosaics_2.26.0.tar.gz
Windows二进制 mosaics_2.26.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) mosaics_2.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/马赛克
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网