- 家
- Bioconductor 3.11
- 软件包
- 马赛克
马赛克
DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaics
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅马赛克。
马赛克(基于模型的一个和两个样品分析和推理ChIP-Seq)
Bioconductor版本:3.11
这个包提供了函数拟合马赛克和MOSAiCS-HMM,统计框架来分析一个样品或两个示例ChIP-seq转录因子的数据绑定和组蛋白修饰。
作者:东峻涌裴分矿,Rene韦尔奇,Sunduz凯尔
维护人员:东峻涌<东峻。钟在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“马赛克”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“马赛克”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“马赛克”)
| R脚本 | 马赛克 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 生物信息学,ChIPseq,遗传学,测序,软件,转录 |
| 版本 | 2.26.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(9.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 3.0.0)、方法、图形、Rcpp |
| 进口 | 质量样条函数,晶格,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,GenomeInfoDb,S4Vectors |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | mosaicsExample |
| SystemRequirements | Perl |
| 增强了 | 平行 |
| URL | http://groups.google.com/group/mosaics_user_group |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | mosaics_2.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | mosaics_2.26.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | mosaics_2.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/马赛克 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
