mitoODE

DOI:10.18129 / B9.bioc.mitoODE

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

此包适用于Bioconductor 3.11版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见mitoODE．

“全基因组RNAi活细胞成像试验中表型的动态建模”中描述的微分方程模型的实现

Bioconductor版本:3.11

该软件包包含了在细胞计数数据上拟合细胞周期模型的方法和重现我们的论文“全基因组RNAi活细胞成像分析中表型的动态建模”(Pau, G.， Walter, T.， Neumann, B.， Heriche, J.-K)中所示结果的代码。李文杰，李文杰，李文杰，李文杰，英国BMC生物信息学杂志(2013)，14(1)，308。doi: 10.1186 / 1471-2105-14-308

作者:Gregoire Pau

维护者:Gregoire Pau < Pau。格雷瓜尔在gene.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mitoODE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“mitoODE”)

PDF	R脚本	mitoODE
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，ExperimentData，ImmunoOncology，预处理，软件，TimeCourse
版本	1.26.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(7年)
许可证	LGPL
取决于	R (>= 2.14.0)，minpack.lm，质量平行,mitoODEdata，KernSmooth
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	mitoODE_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	mitoODE_1.26.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	mitoODE_1.26.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mitoODE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mitoODE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mitoODE/
软件包下载报告	下载数据